Présentation faite dans le cadre de le Fête de la Science, octobre 2024 - Muséum d’histoire Naturelle de La Rochelle.

L'ADN environnemental et la conchyliculture : étude de cas dans les Pertuis Charentais – 02 octobre 2024

Dans le cadre des conférences de la Société des Sciences Naturelles de la Charente-Maritime et de la Fête de la Science 2024 de la Rochelle, Jean François Pépin a été sollicité par la SSNCM pour donner une conférence grand public intitulée « L'ADN environnemental et la conchyliculture : étude de cas dans les Pertuis Charentais » (mercredi 2 octobre 2024 - Muséum d’histoire Naturelle de La Rochelle).

Résume : Contextualisation de la conchyliculture et de ses enjeux dans les Pertuis Charentais sur les quinze dernières années, définitions sur des notions de biologie moléculaire en lien avec l’ADN, les gènes marqueurs et l’ADN environnemental (ADNe). Présentation de méthodes d’étude de l’ADNe, selon des approches ciblées (PCR) ou non ciblées (métabarcoding). Ces approches rendent possibles et accessibles la description des espèces présentes dans un environnement sur des bases génétiques, y compris en milieu marin (eau, sédiment). En lien avec la conchyliculture, trois cas d’études réalisées ces dix dernières années à l’Ifremer de la Tremblade sont évoquées pour mettre en lumière le potentiel des approches associées à l’ADNe : i) la détection de bactéries potentiellement pathogènes associées aux épisodes de mortalité massive des moules dans les Pertuis (projet MORBLEU), ii) la mise en évidence dans les Pertuis d'une algue au potentiel toxique à partir de son ADN dans le cadre des suivis de la biodiversité microbienne opéré par le réseau ROME, iii) la recherche récente d'espèces marines non-indigènes dans les Pertuis Charentais (projet RAPSODI).